Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB1

ELP4, Elongator complex protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP4Q96EB1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ELP4Q96EB1 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms