Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms