Protein–RNA interactions for Protein: Q96BA8

CREB3L1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L1Q96BA8 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CREB3L1Q96BA8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms