Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ0

HAVCR2, Hepatitis A virus cellular receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR2Q8TDQ0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HAVCR2Q8TDQ0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms