Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF548Q8NEK5 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ZNF548Q8NEK5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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