Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
LINC00612Q8N6U2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
LINC00612Q8N6U2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms