Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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CLDN19Q8N6F1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN19Q8N6F1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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