Protein–RNA interactions for Protein: Q69YN4

VIRMA, Protein virilizer homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIRMAQ69YN4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VIRMAQ69YN4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VIRMAQ69YN4 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms