Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FRMPD1Q5SYB0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms