Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALFQ53S48 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms