Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LACTB2Q53H82 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LACTB2Q53H82 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms