Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

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Length 65 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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KRTAP20-2Q3LI61 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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