Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NBPF1Q3BBV0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NBPF1Q3BBV0 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms