Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KLHL38Q2WGJ6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms