Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms