Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Q1T7F1 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Q1T7F1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC9.34□□□□□ -0.91
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