Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDO1Q16878 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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