Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
HIST2H2BEQ16778 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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HIST2H2BEQ16778 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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HIST2H2BEQ16778 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
HIST2H2BEQ16778 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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