Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms