Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SGCAQ16586 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SGCAQ16586 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SGCAQ16586 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SGCAQ16586 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SGCAQ16586 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SGCAQ16586 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SGCAQ16586 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SGCAQ16586 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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