Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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EXT1Q16394 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EXT1Q16394 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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EXT1Q16394 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
EXT1Q16394 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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