Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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VAMP3Q15836 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
VAMP3Q15836 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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