Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHRNA6Q15825 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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