Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EFNB3Q15768 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EFNB3Q15768 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms