Protein–RNA interactions for Protein: Q15464

SHB, SH2 domain-containing adapter protein B, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHBQ15464 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SHBQ15464 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SHBQ15464 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SHBQ15464 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SHBQ15464 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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