Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCARF1Q14162 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SCARF1Q14162 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCARF1Q14162 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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