Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL9A3Q14050 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL9A3Q14050 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL9A3Q14050 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL9A3Q14050 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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COL9A3Q14050 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
COL9A3Q14050 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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