Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
GTF2H3Q13889 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms