Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOFQ13790 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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APOFQ13790 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOFQ13790 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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