Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CUL4BQ13620 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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