Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GRIN2BQ13224 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GRIN2BQ13224 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
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