Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.68e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.658e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 KDM6A-203ENST00000414389 4189 ntTSL 54.37□□□□□ -1.718e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.728e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 KDM6A-204ENST00000431196 735 ntTSL 33.11□□□□□ -1.918e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.038e-6■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 ANP32B-202ENST00000473205 687 ntTSL 312.97□□□□□ -0.331e-9■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 ANP32B-203ENST00000486769 400 ntTSL 211.56□□□□□ -0.561e-9■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 WDR77-202ENST00000449340 877 ntTSL 59.59□□□□□ -0.876e-12■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 NUCKS1-202ENST00000464938 228 ntTSL 22.51□□□□□ -2.011e-9■□□□□ 10.7
TARDBPQ13148 EIF2S3-201ENST00000253039 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.251e-14■□□□□ 10.6
TARDBPQ13148 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-7■□□□□ 10.6
TARDBPQ13148 ABCF1-204ENST00000468958 606 ntTSL 312.54□□□□□ -0.43e-6■□□□□ 10.6
TARDBPQ13148 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.83e-6■□□□□ 10.6
TARDBPQ13148 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.823e-6■□□□□ 10.6
TARDBPQ13148 ABCF1-203ENST00000441867 1074 ntTSL 59.72□□□□□ -0.853e-6■□□□□ 10.6
TARDBPQ13148 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.362e-7■□□□□ 10.6
TARDBPQ13148 KIDINS220-209ENST00000489024 4084 ntTSL 58.1□□□□□ -1.112e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 KIDINS220-201ENST00000256707 7361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.232e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.232e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 KIDINS220-210ENST00000496383 3220 ntTSL 56.82□□□□□ -1.322e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 KIDINS220-213ENST00000638224 806 ntTSL 55.97□□□□□ -1.452e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 KIDINS220-208ENST00000488729 5988 ntTSL 1 (best)5.92□□□□□ -1.462e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 KIDINS220-212ENST00000569008 8735 ntTSL 55.81□□□□□ -1.482e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 HMGN1-212ENST00000479586 841 ntTSL 218.25■□□□□ 0.516e-12■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 HMGN1-219ENST00000491183 527 ntTSL 218.18■□□□□ 0.56e-12■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 HMGN1-211ENST00000471260 615 ntTSL 313.6□□□□□ -0.236e-12■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 GPCPD1-207ENST00000633552 571 ntTSL 55.62□□□□□ -1.515e-7■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 GPCPD1-205ENST00000481038 6649 ntTSL 24.43□□□□□ -1.75e-7■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 GPCPD1-202ENST00000418646 4015 ntTSL 54.2□□□□□ -1.745e-7■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 NCL-206ENST00000454824 606 ntTSL 36.77□□□□□ -1.338e-11■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 FANCA-202ENST00000389301 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 FANCA-230ENST00000568369 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.753e-6■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.115e-8■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 COG5-210ENST00000605888 576 ntAPPRIS ALT2 TSL 213.66□□□□□ -0.225e-8■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.235e-8■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.335e-8■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 ZNF789-206ENST00000468705 484 ntTSL 39.06□□□□□ -0.965e-8■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 35.8□□□□□ -1.485e-8■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.632e-9■□□□□ 10.5
TARDBPQ13148 AL355478.1-201ENST00000431686 821 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.051e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 UBN2-203ENST00000486663 589 ntTSL 46.08□□□□□ -1.441e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 GNB1-207ENST00000472614 708 ntTSL 222.31■■□□□ 1.162e-11■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.12e-11■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.852e-11■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.542e-11■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 GNB1-202ENST00000434686 684 ntTSL 311.13□□□□□ -0.632e-11■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 GNB1-204ENST00000439272 602 ntTSL 59.34□□□□□ -0.912e-11■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 MAP3K20-205ENST00000468408 585 ntTSL 317.7■□□□□ 0.422e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 MAP3K20-206ENST00000476618 4010 ntTSL 1 (best)9.42□□□□□ -0.92e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 MAP3K20-204ENST00000422149 661 ntTSL 48.4□□□□□ -1.062e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 MAP3K20-208ENST00000539448 2312 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.12e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 MAP3K20-201ENST00000338983 7179 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.142e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.612e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 ZNF385A-208ENST00000549962 572 ntTSL 417.71■□□□□ 0.434e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.384e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 ZNF385A-210ENST00000550774 545 ntTSL 415.35■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.074e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.163e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.393e-6■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 MFGE8-210ENST00000559259 611 ntTSL 217.03■□□□□ 0.329e-9■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 NUP214-204ENST00000453861 3208 ntTSL 59.54□□□□□ -0.881e-8■□□□□ 10.4
TARDBPQ13148 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.064e-8■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 EIF3E-215ENST00000522445 841 ntTSL 37.6□□□□□ -1.192e-9■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 EIF3E-209ENST00000519627 697 ntTSL 25.68□□□□□ -1.52e-9■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 EIF3E-207ENST00000519413 419 ntTSL 34.57□□□□□ -1.682e-9■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 EIF3E-214ENST00000522352 611 ntTSL 35.43□□□□□ -1.542e-9■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.592e-9■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 EIF3E-208ENST00000519517 726 ntTSL 35.01□□□□□ -1.612e-9■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.742e-9■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 EIF3E-212ENST00000521614 1990 ntTSL 22.85□□□□□ -1.952e-9■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.013e-12■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.173e-12■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-12■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 MKNK2-210ENST00000589534 454 ntTSL 226.62■■□□□ 1.858e-8■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.478e-8■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 MKNK2-205ENST00000586828 1503 ntTSL 218.97■□□□□ 0.638e-8■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.048e-8■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 MKNK2-209ENST00000589509 352 ntTSL 511.45□□□□□ -0.588e-8■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 MKNK2-213ENST00000591601 3582 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.588e-8■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.43e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.43e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-206ENST00000444450 888 ntTSL 517.15■□□□□ 0.343e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-209ENST00000491235 589 ntTSL 316.02■□□□□ 0.163e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-211ENST00000497043 851 ntTSL 516■□□□□ 0.153e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.133e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-208ENST00000461215 757 ntTSL 515.83■□□□□ 0.123e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-210ENST00000495356 756 ntTSL 215.68■□□□□ 0.13e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.063e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -03e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 MKI67-202ENST00000368654 12678 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.973e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 URB1-201ENST00000382751 10832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.083e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.383e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.473e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 CPNE3-208ENST00000614678 4201 ntTSL 1 (best)5.67□□□□□ -1.53e-7■□□□□ 10.3
TARDBPQ13148 WDR1-209ENST00000505851 715 ntTSL 221.97■■□□□ 1.119e-7■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.419e-7■□□□□ 10.2
TARDBPQ13148 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.049e-7■□□□□ 10.2
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