Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GPS1Q13098 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
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