Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FOXF1Q12946 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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FOXF1Q12946 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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FOXF1Q12946 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FOXF1Q12946 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FOXF1Q12946 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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FOXF1Q12946 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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FOXF1Q12946 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FOXF1Q12946 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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