Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
NIPAL4Q0D2K0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms