Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CENPCQ03188 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CENPCQ03188 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms