Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXOSC10Q01780 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms