Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FGD1P98174 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
FGD1P98174 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
FGD1P98174 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
FGD1P98174 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
FGD1P98174 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
FGD1P98174 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD1P98174 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD1P98174 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD1P98174 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD1P98174 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD1P98174 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD1P98174 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD1P98174 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
FGD1P98174 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms