Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
HERVK_113P63121 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms