Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAB1AP62820 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RAB1AP62820 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms