Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FBXW4P57775 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FBXW4P57775 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms