Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CLDN8P56748 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms