Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNQ4P56696 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNQ4P56696 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms