Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CASP9P55211 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP9P55211 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms