Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF135P52742 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF135P52742 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms