Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CSNK1A1P48729 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms