Protein–RNA interactions for Protein: P48539

PCP4, Calmodulin regulator protein PCP4, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCP4P48539 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PCP4P48539 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 AC022384.1-202ENST00000450534 2831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 AC134407.3-201ENST00000624035 2139 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ZSWIM3-201ENST00000255152 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PCP4P48539 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 DHX58-201ENST00000251642 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SNHG20-202ENST00000434411 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 OCA2-201ENST00000353809 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 IMMT-204ENST00000410111 3001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TBC1D8B-202ENST00000310452 2589 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 PID1-203ENST00000392055 2533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 RBM15-205ENST00000618772 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 PDE2A-201ENST00000334456 4315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
PCP4P48539 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms