Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NSG1P42857 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NSG1P42857 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NSG1P42857 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms