Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZEB1P37275 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZEB1P37275 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms