Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HOXC12P31275 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HOXC12P31275 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms